生物工具 GTF.py 提供一个类,使您可以解析,重建仅由外显子组成的GTF或计算一些基本统计信息。 用法 从CLI 要仅从外显子重建完整的GTF(具有3个级别:基因,转录本和外显子),请使用以下命令,然后将重建的GTF打印到STDOUT GTF.py format {gtf_path} 要计算您的GTF(仅包含外显子的GTF)中的基因,转录本和外显子的数量,请使用: GTF.py stats {gtf_path} 从Python脚本 首先,导入GTF类。 此类提供了一种静态方法来解析您的文件: 您的GTF由3个级别的注释组成。 在这种情况下,请使用: from GTF import GTF for gene in GTF . parse ({ your GTF file }): print ( gene ) 您的GTF仅由外显子组成。 在这种情况下,请添加arg by
2022-12-03 14:48:00 3KB Python
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qPCR结果查看与分析1
2022-11-28 14:20:19 357KB 生物信息学
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qPCR结果查看与分析2(graphpad)
2022-11-28 14:20:18 18KB 生物信息学
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序列的多重比对是生物序列分析研究中的一个重要方法。文章首先介绍了HMM 的基本结构,然后着重讨论了HMM 在DNA 序列之间的多重比对中的应用。
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生物信息学的参考书;有文献数据挖掘的详细讲解;介绍文献编辑软件以及相关课堂练习;核酸,蛋白质序列分析以及数据分析以及相关上机操作的作业流程
2022-11-07 12:34:22 170.35MB 生物信息 核酸 蛋白质 数据挖掘
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分子生物信息学分析软件,主要用于SSR、ISSR等分子标记进行物种生物信息相关分析
2022-10-29 15:13:39 1.6MB ntsys
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DIY Doedcad 2.1允许使用不完整的基因数据文件,即不完全包括计算器中使用的全部SNP标记的基因数据文件,并允许该工具用于类23andMe或FTDNA格式的基因数据。源文件自带Dodecad V3祖源计算器,详情请阅读“README DIYDodecad.txt”。
2022-10-22 19:04:53 7.41MB 祖源分析 生物信息学 基因检测
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《 Python手册中的生物信息学》,第二版 这是Packt发行的代码库。 了解如何使用现代Python生物信息学库和应用程序进行计算生物学的前沿研究 这本书是关于什么的? 生物信息学是一个活跃的研究领域,它使用一系列简单而先进的计算来从生物数据中提取有价值的信息。 本书涵盖了下一代测序,基因组学,宏基因组学,种群遗传学,系统发育学和蛋白质组学。 您将学习现代的编程技术来分析大量的生物学数据。 借助实际示例,您将使用各种Python工具和库来转换,分析和可视化数据集。 本书涵盖以下激动人心的功能: 了解如何处理大型下一代测序(NGS)数据集 使用FASTQ,BAM和VCF格式处理基因组数据集 学习进行序列比较和系统发育重建 使用Protemics数据执行复杂的分析 使用Python与Galaxy服务器进行交互 如果您觉得这本书适合您,请立即获取! 说明和导航 所有代码都组织在文件
2022-10-20 14:46:49 12.5MB OpenEdgeABL
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这是许忠能编写的生物信息学,适用于计算机专业和生物相关专业的人士使用。
2022-09-28 21:19:28 26.76MB 生物信息学
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用python编写生物信息学中的程序,生物信息学的同学可以看看,个人感觉还是不错
2022-09-27 10:08:02 6.83MB python 生物信息
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