matlab跳动的心代码CaCLEAN算法 在跳动的心肌细胞中,从ryanodine受体(RyR)簇中同步释放的局部Ca2 +是决定细胞收缩力和心脏输出量的最重要因素。 基本性质,包括此类单个簇的释放可靠性,对于了解心脏疾病(如心律不齐和心力衰竭)的发展尤其重要。 通过将天文CLEAN算法与已知的Ca2 +扩散特性相结合,开发了新颖的革命分析方法CaCLEAN算法,以了解在跳动的心肌细胞中释放Ca2 +的RyR簇的行为。 功能列表和注意事项: CICRcleanSimp:CICRcleanSimp计算钙释放图,它是CaCLEAN算法的内核函数。 CICRrebuildSimp:CICRrebuildSimp从通过CaCLEAN算法得出的钙释放图计算出钙瞬变的上升趋势。 CICRsimulation:CICRsimulation模拟心脏钙瞬变的共聚焦记录。 CRUProps:CRUProps分割钙释放图并计算单个钙释放单位(CRU)的属性。 generatePSF:内部函数,用于生成分析清洁对象(ACO)。 ACO类似于点扩展功能。 SampleCell:SampleCell生成样本的心
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蛋白质终身计划 该python脚本允许用户遵循N端规则获得细胞中蛋白质的寿命,通过该规则,蛋白质半衰期是由蛋白质序列中的最后一个氨基酸计算出来的。 背景 90年代,亚历山大·瓦尔沙夫斯基(Alexander Varshavsky)和他的团队首先描述了N端规则。 它将蛋白质的体内半衰期与其N末端残基的身份联系起来。 他得出的结论是,N-末端规则的相似但截然不同的版本适用于所有生物,从哺乳动物到真菌再到细菌。 因此,据此,应该有可能从蛋白质序列计算蛋白质的半衰期,并使用生物信息学方法估算蛋白质在细胞中的寿命。 代码 该代码是使用Spyder版本4.2.3(是Python开发环境)使用Python3版本3.8开发的。 可以使用跨平台的Anaconda发行版下载Spyder。 Python模块 在使用此脚本之前,建议使用Anaconda Prompt安装以下Python模块: PySimpleG
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