openmm-tutorials：快速入门Python教程，帮助分子动力学从业人员快速掌握OpenMM

林德曼 lindemann是一个Python软件包，用于计算LAMMPS轨迹的Lindemann指数以及每帧温度斜坡的Lindemann指数的变化，以进行相变分析。 安装 它需要python 3.7 pip install lindemann 或与Poetry安装 poetry add lindemann 用法 lindemann [OPTIONS] TRJFILE 或与Poetry安装： poetry run [OPTIONS] TRJFILE 注意事项： 尽管有-t标志，但在运行任何标志之前，请确保您有足够的可用内存。您可以使用-m或--mem_use选项检查内存使用情况。带有轴的numpy.nanmean（）函数可用于numba时，将修复高内存使用情况。 多重处理： 如果您没有可用于分配工作负载的hpc环境，则在使用本地计算机的情况下，我添加了多处理来并行化任务。只需使用-

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The Art of Molecular Dynamics Simulation 第二版的源码 非常经典！