%% TPR2PDB.m % % Gromacs 对于模拟全原子系统很有用，它启动了这些% 使用 TPR 文件进行模拟。 所有 TPR 文件都包含坐标数据% 启动模拟。 有时打开并检查它是有用的％ 结构体。 该程序提取它并将其转换为 PDB 格式以供% 方便查看。 提取的信息是坐标、原子类型、 % 和部分费用。 部分费用存储在 beta-factor 列中% 的输出文件。 % % ％ - - - 要求 - - - % % GROMACS % 这个程序使用 Gromacs 命令“GMXdump”来创建一个文本％ 文件。 这避免了 Gromacs 可能出现的任何问题% 更新和版本更改。 确保此命令有效％ 小路。 % % gmxdump ％ 看上面。 启动这个文件的命令是% $> gmxdump -s [TPR 文件] > textForAnalysis.txt % 如果这不能正确完成，

PDB 蛋白质 结构 数据集，是一个专门收录蛋白质及核酸的三维结构资料的数据库，拥有十分悠久的历史，由美国布鲁克黑文国家实验室的 Walter Hamilton 于 1971 年起开始构建收集。 PDB 数据库中信息主要包含：蛋白质/核酸来源，蛋白质/核酸分子组成，原子坐标，测定结构所用实验方法，以及温度因子、结构测定者等其它数据及信息。可以在 PDB 数据库查找核糖体、致癌基因、药物靶标，甚至整个病毒的结构。

1. PDB数据库中查找蛋白质结构数据 1.　http://www.rcsb.org/pdb/home/home.do 2. 查找蛋白质结构，在检索框输入关键字或名称。 二. 在线观看三维数据结构 4. 选择 3D view，可视化蛋白三维结构视图呈现。由于是远程计算机服务器进行图型构建，且数据 量较大，需要较长的时间才能在窗口显示。 5.蛋白结构显示的参数设定： 脚本选项： 2. 下载三维数据文件 1. 在查询结果窗口的右边找到以下图型。 如图：选择Download Files。 2．确定下载的文件类型，一般根据你要使用蛋白质结构数据而定。 选择PDB File(Text). 3. 用写字板打开PDB文件，可以看到蛋白质数据库文件实质也是文本文件。 4. 下载Pymol，并安装。点DOWNLOAD进入下载，选择windows版本，并安装（需要pay money）。 或到此网站下载：http://www.lfd.uci.edu/~gohlke/pythonlibs/#pymol 选择win32，1.7.1.1版本。并安装，需要python编程软件的支持，可从360软件管件直接 安装。安

pdb2mdb 工具，参数是dll名称

1，Qt 5.15.3 LTS作为一个补丁版本，没有增加任何新的功能，提供了错误修复和一些其他改进。与 5.15.2 相比，包含了近 250 个错误修复； 2，可惜的是官网没有离线安装包和在线安装包，仅提供源码下载，需自己编译安装； 3，安装压缩包采用msvc2019编译，生成64位共享库版本，支持Qt基础库、opengl、webengin等插件模块。 4，下载后配置好VS环境变量，可直接引用，进行应用开发，希望能给有需要的伙伴提供一些帮助，谢谢！

锈-pdb Rust 中的文件解析器。

python库，解压后可用。 资源全名：pdb_manip_py-1.3.4-py2.py3-none-any.whl

PDBExplorer是一款能够帮助用户查询.pdb为后缀的文件中内容的软件，通过PDBExplorer用户能够对某个.pdb文件进行快速的关键词检索，软件能够查询到文件中的符号名称和所有的地址信息，是

c++ 开发人员创建的工程文件夹下有很多占用大量空间的文件，该工具可以选择目录，并删除目录下面所有的大文件，减小存储和传输压力。 若 debug 或 release 下面有dll文件，可能为重要外部文件，则不删除

pdb蛋白质数据库中pdb文件格式介绍，把网站上的帮助文档做成了chm的电子书形式，方便观看。