CRUMp基于称为分类相关单位机器(CRUM)的基于内核的学习方法。 给定一组以FASTA格式输入的蛋白质序列,系统将输出位置,残基类型(S,T或Y)以及每个被测位点可磷酸化的估计概率。 最新可下载文件:-crump-0.2.0.tar.gz:CRUMp GNU Octave软件包-crump-0.2.0.zip:CRUMp MATLAB脚本-crumptestset.fasta:FASTA格式的测试数据集。 序列头列出了蛋白质序列的登录号和已知磷酸化位点的位置号。 请注意,CRUMp可能会预测尚未通过实验验证的其他磷酸化位点。 测试数据集来自Biswas等。 2010,http://www.biomedcentral.com/1471-2105/11/273/additional。
2021-04-29 13:04:36
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