彩色编码强度的matlab代码MATLAB中的颜色反卷积
背景
颜色反卷积由Ruifrok等人介绍。
在2001年[1]中描述了一种从组织学玻片的RGB图像中提取染色强度的方法。
颜色反卷积被广泛用于组织学中的图像处理,并且有非常有效的Fiji和Python实现(请参见下文,[2])。
该存储库提供了颜色反卷积的高效Matlab实现。
该代码部分基于中的python实现。
例子
原始图像预览
斐济输出
面板:原始-苏木精-DAB-残留
源图像用苏木精和DAB染色。
第三个通道代表残差,应为空。
在这里,反卷积矩阵的标准值拟合得很好,并且残差很小。
我的代码输出
输出类似于斐济的输出(请注意,通过拉伸直方图可以增强对比度)。
残差的直方图也被拉伸,可以理解,残差本质上是随机噪声,因此它不包含很多信息。
去做
修复反色反卷积函数中的对比度缩放(RecombineStains)
有关颜色反卷积的更多资源
斐济实施说明
python
scikit-image实现
斐济实施的深入说明
Antony
Chan的另一个Matlab实现(由于两个嵌套的for循环而变慢)
Matlab的另一个实现:
参
2021-08-13 16:04:18
3.31MB
系统开源
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