已开发出NOFI分级算法,将低优先级分配给受干扰影响的碎片离子。 该实现是可以自定义的R脚本。 将来的版本将包含模块化版本。 概述如下:1)输入包含通过软件工具(例如Skyline和OpenSWATH)从已鉴定和定量的肽中得到的SWATH碎片离子XIC的列表。 2)NOFI的第一步是计算用于将每个碎片离子表示为矢量的4个属性(RTd,FWHMd,IRd和IRrep)。 3)使用多元离群值检测技术对来自每个肽段的所有碎片离子进行排名。 4)生成了多个图形(pdf文件),以可视化Top-N碎片离子对不同指示剂的影响。 5)用户可以选择每个肽段的最高片段离子数,从而利用高优先级Top-N NOFI的最佳子集进行定量,同时排除受损的片段离子。
2021-04-29 22:04:03
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开源软件
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