基于Markov亲和力的细胞图插补（MAGIC） 基于马尔可夫亲和力的细胞图插补（MAGIC）是一种用于对最常应用于单细胞RNA测序数据的高维数据进行去噪的算法。 MAGIC使用结果图对特征进行平滑处理并恢复数据的结构，从而学习流形数据。 要了解如何将MAGIC应用于单细胞RNA序列，阐明上皮到间充质的转变，请阅读的。 MAGIC已在Python，Matlab和R中实现。 要立即开始，请查看我们的教程： Python 骨髓教程 [R 上皮到间质过渡教程 骨髓教程 魔术揭示了波形蛋白（VIM），钙黏着蛋白1（CDH1）和锌指结合E-box的同源盒1（ZEB1，由颜色编码）之间的相互作用。 目录 Python 安装 用pip安装 从GitHub安装 用法 快速开始 讲解 Matlab的Matlab版本的说明 [R 安装 从CRAN安装 从GitHub安装 用法 快速开

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神经适应症 NeuroFIT 正在建设中！ NeuroFIT 目前正在建设中。 请注意，对此存储库的提交旨在按原样演示当前功能。 基本上，您可以在按下运行按钮时预期一切正常，而无需更改任何参数，如果更改参数，则一切都不起作用。 希望这条消息很快就会消失——当它消失时，工具箱应该是完全可用的。 直到那时... 用于 Matlab 的细胞/神经元荧光成像工具箱 NeuroFIT 是一个用于 Matlab 的细胞/神经元荧光成像工具箱。 它有几个不错的功能，包括： 图形用户界面 从串行部分创建图像 z 堆栈 动画 z 堆栈演练预览 自动细胞和背景检测 自动细胞识别和追踪 各种像素强度统计 图像和颜色通道比较 快速统计输出 开源开发！ 预览 - 荧光成像和细胞自动跟踪 预览 - 神经元的自动 3D 重建

这是包含肺腺癌单细胞数据集分析的存储库 入门 克隆 repo 从下面的链接下载 Data_input 文件夹到 repo： ://drive.google.com/drive/folders/1sDzO0WOD4rnGC7QfTKwdcQTx3L36PFwX?usp=sharing 脚本 导入和创建 Seurat 对象 01_Import_data_and_metadata.Rmd ：导入原始数据和元数据。 此 scipt 的输出保存为"S01_Data_and_metadata.RData" 。 02_Create_Seurat_object.Rmd ：从脚本 01 导入 .RData 对象。创建初始 Seurat 对象并执行初始质量控制。 最终输出对象保存为"S02_Main_Seurat_object_filtered.RData" 。 02.1_Create_Seurat_o

利用细胞神经网络(CNN)模型导出了一种新的彩色图像边缘检测算法。为了充分利用图像中的颜色信息, 在RGB 彩色空间中用Mahalanobis 距离来度量象素之间的差异。为了解决常规边缘提取方法输出二值结果的缺点, 采用可以多值输出的CNN 来进行彩色图像边缘检测。通过Mahalanobis 距离对灰度CNN 度量象素差异的方式进行改进, 使其可以在RGB 彩色空间中进行运算。通过与Sobel、Log 和Canny 等几种边缘检测算子比较, 可以看出新方法的结果更加符合人眼的感知。此外, 在含有丰富细节和微小变化的区域, 新方法可以取得更好的结果。

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