群落构建分析是微生物生态学分析重要的组成部分,成为目前文章发表的热点技术。之前我们介绍了计算beta-NTI(beta nearest taxon index)来进行群落构建分析,但利用beta-NTI推测群落构建有一个前提条件,即系统发育树必须要有遗传信号(phylogenetic signal),但某些功能基因(例如nifH)的遗传发育树往往缺乏遗传信号,此时我们可以计算beta多样性的零偏差来进行群落构建分析。本文包括如下三方面内容,1、如何理解beta多样性零偏差?2、如何计算beta多样性零偏差?3.多核运行可以省多少时间?
2021-12-30 19:03:47 380KB 微生物生态学分析 群落构建
基于GPU并行计算的Delaunay三角剖分算法研究与实现
2021-12-30 01:41:58 621KB 研究论文
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matlab开发-33500任意波形函数。使用Matlab向安捷伦33522A、33521B、33522B和其他发电机发送任意波形
2021-12-27 21:09:22 2KB 并行计算
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实现消费者和生产者的C++代码,三个线程按照顺序对三个文本文档进行读写
2021-12-25 21:46:16 565KB 并行计算
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mpi实现块排,亲身测验。。。。。。。。。。。。。。。
2021-12-25 15:16:45 2KB 并行计算 mpi 块排
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消息传递接口标准(MPI)是基于MPI论坛共识的消息传递库标准,MPI论坛有40多个参与组织,其中包括供应商,研究人员,软件库开发人员和用户。消息传递接口的目标是为消息传递建立一种可移植,高效且灵活的标准,该标准将广泛用于编写消息传递程序。因此,MPI是第一个标准化的,独立于供应商的消息传递库。使用MPI开发消息传递软件的优势与可移植性,效率和灵活性的设计目标紧密匹配。MPI不是IEEE或ISO标准,但实际上已成为在HPC平台上编写消息传递程序的“行业标准”。 本教程的目的是教那些不熟悉MPI的人如何按照MPI标准开发和运行并行程序。提出的主要主题集中于对新MPI程序员最有用的主题。本教程首先介绍MPI入门,背景和基本信息。接下来是对MPI例程的详细介绍,这些例程对新MPI程序员最有用,包括MPI环境管理,点对点通信和集体通信例程。提供了C和Fortran中的大量示例以及实验室练习。 教程材料还包括更多高级主题,例如派生数据类型,组和Communicator管理例程以及虚拟拓扑。但是,这些实际上并没有在讲座中介绍,而是为有兴趣的人提供“进一步的阅读”。
2021-12-25 14:36:53 1.54MB MPI 云计算 并行计算
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该软件包包含基于 Dong 等人的出版物的基于生理学的药代动力学 (PBPK) 模型。 随附的代码可用于: * 计算参数估计和模型预测的置信区间(SimBiology 函数:sbioparameterci、sbiopredictionci) * 对 PK 数据集进行非房室分析 (NCA),以及模型预测以获得临床相关参数(SimBiology 功能:sbionca) * 说明使用并行计算的理由,例如通过引入 MATLAB 函数以及它们如何与 SimBiology(MATLAB 函数:datastore、parfor、mapreduce)结合来处理内存不足模拟和提高性能在以下网络研讨会中也讨论了此模型和代码: http://www.rosaandco.com/webinars/2017/enabling-qsp-and-pk-pd-workflows-using-simbiology-and-
2021-12-24 21:54:00 974KB matlab
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C3模型是并行计算模型中的一种,这个ppt是我们总结出来的,对C3模型有详细的讲解
2021-12-24 01:03:32 93KB C3模型
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  并行计算或称平行计算是相对于串行计算来说的。所谓并行计算可分为时间上的并行和空间上的并行。 时间上的并行就是指流水线技术,而空间上的并行则是指用多个处理器并发的执行计算。
2021-12-22 10:26:25 185KB 分布式计 并行计算 文章 技术应用
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这是美国LLNL国家实验室的并行计算培训课程之一,是学习并行程序设计的入门材料。
2021-12-21 15:06:04 433KB 并行计算
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