针对高维小样本的DNA微阵列数据多分类问题,提出一种基于ReliefF和蚁群算法的特征基因选择方法(ReliefF and ant colony optimization,ReFACO)。该方法首先采用ReliefF算法评估特征权重,根据阈值筛选出无关基因;然后引入改进的蚁群算法,在迭代改进的过程中寻找最优基因子集;最后利用经典分类算法对维数约简后的数据分类识别。经实验证明,该方法可有效地剔除无关和冗余基因,并利用较少特征基因达到较高多分类效果。
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脱氧核糖核酸 这是一个 Python 脚本,用于将任意计算机文件编码/解码为 DNA 序列。 这是一个直实施刊登在方法的性质的文件。 该方法的详细信息可以在 报告中找到。 另一个版本的报告可以在。 源代码组织遵循文章步骤和命名法,所以应该很容易理解。 如何使用 使用 pip 安装它: $ sudo pip install file2dna 安装的脚本将被称为dna并接受四种类型的操作作为参数与文件名一起传递: $ dna -h usage: dna [-h] [-e | -s | -d | -j] file positional arguments: file File to be encoded/decoded. optional arguments: -h, --help show this help message and exit -e
2021-09-13 10:53:32 1.49MB Python
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利用模式匹配算法,实现课件中的案例 4.1: 病毒感染检测。 问题描述如下: 研究者将人的 DNA 和病毒 DNA 均表示成由一些字母组成的字符串序列。 然后检测某种病毒 DNA 序列是否在患者的 DNA 序列中出现过,如果出现过,则此人感染 了该病毒,否则没有感染。 例如,假设病毒的 DNA 序列为 baa,患者 1 的 DNA 序列为 aaabbba,则感染,患者 2 的 DNA 序列为 babbba,则未感染。(注意,人的 DNA 序列是线性的,而病毒的 DNA 序列是环状 的)。 要求:相关信息从文件"病毒感染检测输入数据.txt"读入,将检测结果写入到文件"病 毒感染检测输出结果.txt"中。运行结果如下所示: 提高内容: 利用 KMP 算法进行匹配
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2021-09-06 17:00:07 1.11MB APT 应急响应 数据分析 安全体系