matlab图像分割肿瘤代码基于熵的医学影像学可视化工具
该代码提供了用于可视化牙龈纤维的工具。
它提供了后处理算法,可以过滤纤维并选择带有神经和肿瘤的3D场景中的最佳视点。
输入数据
该代码获取的输入数据是由描记软件产生的描记纤维文件。
数据格式可以是Mrtrix
tck文件或DSIstudio
txt文件。
如果纤维是由Mrtrix生产的,请确保使用体素坐标。
要将结果转换为体素坐标,可以使用Mrtrix的tckconvert函数,如在Shell文件夹中找到的Shell脚本中所述。
如果要向可视化添加片段(例如肿瘤),则必须以nifti格式将其作为二进制图像提供。
使用DSIstudio进行的细分与代码兼容,但是任何其他细分都可能导致错误的放置。
在“数据”文件夹中提供了跟踪的颅神经和颅骨肿瘤分割的样本数据。
筛选
提出了一种基于弹力纤维熵计算的滤波算法。
主文件中提供了使用此算法的示例。
要执行过滤,必须首先使用Entropy
/
entropy_matrix函数计算纤维的熵。
然后,运行Filtering
/
filter_nerve删除对于可视化而言意义不大的纤维。
您必须提
2021-12-15 13:05:51
3.87MB
系统开源
1