tif转原始Matlab代码通过线扫描进行血流分析
该代码旨在分析重复的线扫描以提取血流。
它分两步进行。
在Matlab中,从原始.tif线扫描文件中提取流,并将速度保存到.txt文件中。
在Python中,可分析任意数量的分析文件中.txt文件中的合成速度测量结果。
演算法
使用来自这两个参考的算法和代码:
要求
Matlab
2016b。
也可以与其他版本一起使用。
Kim等人的算法需要使用xxx和yyy工具箱。
Chhatbar和Kara算法需要zzz工具箱。
源行扫描文件需要为.tif
我们需要从每个.tif文件中读取两个采集参数,即行扫描的x体素大小(delx,um
/
pixel)和每次行扫描的速度(delt,ms
/
scan)。
Matlab代码假定您已使用斐济脚本'bFolder2MapManager.v0.2_.py'完成此操作。
运行分析
在运行matlab代码之前,请确保斐济脚本的输出.txt文件全部包含在带有原始.tif文件的文件夹内名为oir_headers的文件夹中。
在Matlab提示符下,您需要使用以下代码将cd插入文件夹,例如
cd
/Users/
2022-03-14 19:05:41
10.87MB
系统开源
1