介绍
该软件包将支持在 Julia 中灵活实施 Gillespie 算法,以及用于表征复杂化学反应系统的分析工具。
将实施许多不同的化学模型,包括: 连接和聚合化学 基于序列的复制化学 反射性自催化和食物生成集 Azoarcus 重组酶系统和其他随机自催化网络
动力学
双分子反应发生的速率常数为
k_r = \frac{c_r}{V} \sqrt{ \frac{R T}{m_ {ij}} }
其中$$c_r对应一些未知的结构和动力学因素,$Tm_{ij}$ 是减少的质量,以道尔顿为单位。两种反应物中,$VR$ 是理想气体
常数。