EN.553.738高维近似,概率和统计学习最终项目 关查理,胡志明,张杰@约翰·霍普金斯大学 在这个项目中,我们探索三种不同的非线性降维/流形学习算法:Isomap,局部线性嵌入(LLE)和扩散图/ Laplacian特征图。 我们在数据集上对这些算法进行基准测试,例如经典的瑞士卷,虹膜,MNIST和神经元尖峰数据。 我们还将它们与主成分分析(PCA)进行比较,后者是一种线性降维算法。 最后,我们有一个使用扩散图的演示来分析氢二聚体的玩具分子动力学模拟的自由能态。 要运行任何基准测试/演示,请启动相应的脚本: python filename.py 。 您可以编辑每个脚本中每个算法中的超参数,例如投影维和相邻算法的数量。 先决条件 脚本要求: 数据集 Swiss Roll和Iris数据集是从sklearn.datasets包生成的。 我们下载了亚·莱卡的网页的数据库MNIST。 神经
2021-04-02 16:39:36 13.34MB Python
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微型泵内液体流动的现代分子动力学模型.zip
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基于lammps软件,基于EAM势模拟金属Ni的剪切行为。附件为word文档,里面包含程序和运行结果。程序需要另存为txt文档,并保存成lammps可运行的in文件。
2021-03-26 10:03:19 156KB lammps分子动力学仿真 Ni剪切行为
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介绍了分子动力学模拟的基础知识,lammps的指令和实例。
2021-03-16 11:13:43 8.5MB lammps 分子动力学
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LAMMPS 后处理 计算应力hydro_stress和von Mises stress的脚本。
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高熵合金FeNiCrCoCu建模及拉伸模拟in文件代码,带应力-应变输出
2021-03-06 17:03:46 395KB lammps 高熵合金 分子动力学模拟 拉伸
分子动力学lammps数据分析、二次开发、拉伸摩擦、非平衡统计、自由能计算学习资料,全套学习资料,分子动力学lammps数据分析、二次开发、拉伸摩擦、非平衡统计、自由能计算学习资料,全套学习资料。
2020-12-15 10:16:13 17.18MB LAMMPS 二次开发 自由能计算 拉伸
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lammps分子动力学基础
2020-01-03 11:33:14 122.44MB 分子动力学基础 lammps
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MS分子动力学模拟具体实施步骤,应用material studio进行分子动力模拟
2019-12-21 22:11:17 683KB MS 分子动力学
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