网络
分子动力学粗粒化()
依存关系
必需的:
numpy
pytorch (1.2或更高版本)
scipy
可选的:
mdtraj (仅适用于cgnet.molecule )
pandas (仅适用于cgnet.molecule )
sklearn (用于测试)
Jupyter ( examples )
matplotlib ( examples )
用法
克隆存储库:
git clone git@github.com:coarse-graining/cgnet.git
安装所有缺少的依赖项,然后运行:
cd cgnet
python setup.py install
笔记
为了与pytorch==1.1兼容,请使用pytorch-1.1分支。 该分支当前不包括变量大小和Langevin动态的更新,也没有某些规范化选项。
引用
请引用预印本:
@article
2022-11-15 17:03:13
1.38MB
Python
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